Les membres des équipes soignantes sont à haut risque
d’infection par le SARS-CoV-2. Un pneumologue sur cinq en contact
avec des patients a été infecté pendant la première vague de
l’épidémie de Covid-19 au Royaume-Uni (entre mars et juillet 2020),
et un sur 3 a dû se confiner au moins une fois du fait de symptômes
ou de contact avec un sujet symptomatique. C’est dire la nécessité
d’un système de surveillance efficace, pour réduire le plus
possible le risque d’infection nosocomiale et limiter le manque de
personnel lors d’un nouveau pic épidémique.
Les tests salivaires sont fiables
En août 2020, des chercheurs de l’université de Yale ont démontré que les prélèvements salivaires étaient aussi sensibles que les prélèvements naso-pharyngés pour la détection du SARS-CoV-2, pendant l’hospitalisation. Ils ont ensuite confirmé ce résultat sur des professionnels de santé asymptomatiques. Cela offre une option supplémentaire pour le dépistage à grande échelle. Mais, si le prélèvement salivaire est plus simple en pratique courante, il ne règle pas tous les problèmes de logistique. Le système serait encore vite débordé en cas de tests pratiqués régulièrement à très grande échelle, avec un délai rapide d’obtention des résultats, tel que l’exigerait un programme de surveillance des équipes soignantes.Et il est possible de tester jusqu’à 32 échantillons mélangés
Pour pallier ces difficultés, une contribution au Lancet propose une solution : la mise en commun (« pooling ») des échantillons de salive. L’amplification du signal Covid-19 par PCR rend le test très sensible pour de faibles concentrations virales, et permet de regrouper et de tester plusieurs prélèvements en un seul test. Si le test d’échantillons « poolés » est négatif, cela signifie que toutes les personnes testées sont négatives. Les auteurs du billet proposent donc un nouveau système de surveillance, qui pourrait, dans un premier temps, être testé chez les professionnels de santé, analysé et corrigé si nécessaire.Au moins une fois par semaine, chaque soignant en contact avec
des patients fournirait 2 prélèvements de salive (échantillons A et
B). L’échantillon A serait regroupé avec les prélèvements d’autres
personnes, et testé. Si le test est négatif au SARS-CoV-2, l’on
peut considérer qu’aucun des donneurs de salive n’est positif. Si
le test est positif, les échantillons B de chaque individu sont à
leur tour testés pour établir le ou les donneurs positifs. Les
premiers travaux indiquent qu’au moins 32 prélèvements peuvent
ainsi être mis en commun.
Les auteurs reconnaissent que cette méthode de regroupement des prélèvements comporte aussi quelques inconvénients. Ils estiment toutefois que, si elle n’est pas idéale, elle est préférable aux délais d’attente des résultats des tests tels que de nombreux pays les connaissent actuellement, et mérite d’être évaluée.
Dr Roseline Péluchon
